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甲基化检测MSP

1)技术简介:DNA甲基化是哺乳类动物一个重要的基因外遗传信号。有研究表明,DNA甲基化与大多数肿瘤的发生相关,抑癌基因启动子CpG岛的高度甲基化可引起抑癌基因表达沉默,细胞出现无节制生长,导致肿瘤的发生。目前,基因的甲基化研究主要结合亚硫酸氢钠处理和PCR技术,分为甲基化特异性PCR(Methylation specific PCR,MSP)和硫化测序PCR(Bisulfite sequencing PCR, BSP)。

2)实验步骤/流程图:

甲基化特异性的PCRMSP原理:

    双链DNA变性解链后,在HSO3-作用下发生C→U转化,C若已有甲基化则无此改变;甲基化修饰只发生于5′→3′方向C-G相联结构的C上,因此在HSO3-作用后,DNA CpG岛若无甲基化,则序列中的改变为C→U,CG→UG,若有甲基化则为C→U,CG→CG,用不同的引物做PCR,即可检测出这种差异,从而确定基因有无CpG岛甲基化。从理论上说,DNA发生甲基化的MSP产物的序列与原序列比较,变化为C→T,CG→CG,相应其互补链的改变为G→A,CG→CG。然后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物并进行聚合酶链反应(PCR)扩增,最后通过琼脂糖凝胶电泳分析,确定与引物互补的DNA序列的甲基化状态。MSP法灵敏度较高,应用范围广。

硫化测序PCRBSP原理:

    结合重亚硫酸盐的测序法是一种灵敏的能直接检测分析基因组DNA甲基化模式的方法。重亚硫酸盐处理后,用针对改变后的DNA序列设计特异性引物并进行聚合酶链式反应(PCR)。 PCR产物中原先非甲基化的胞嘧啶位点被胸腺嘧啶所替代,而甲基化的胞嘧啶位点保持不变。PCR产物克隆后进行测序。通过这个方法能得到特定位点在各个基因组DNA分子中的甲基化状态。

1)客户需提供资料:

1.尽可能新鲜和足量的组织(≥50mg)、细胞样品(≥106)或全血(≥300μl)

2.直接提供纯化好的DNA(≥5μg/样品)

4)最终提供客户资料:

1.完整的实验过程报告;
2.数据分析结果(发表级图片形式)。

5)示例展示:


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